Des startups et scale-ups françaises détaillent leur stack finance. Qonto domine la banque, Pennylane la comptabilité, souvent choisi par le cabinet comptable, et les notes de frais sont l'outil qui change le plus souvent.
Banque, comptabilité, notes de frais, facturation : la stack finance d'une startup se construit par couches, au rythme des besoins. Pour comprendre comment ces choix se font, nous sommes partis des entretiens que Soft Atlas mène avec des dirigeants et des équipes finance et opérations, et des stacks qu'il recense. Treize entreprises françaises nous ont raconté quels outils elles utilisent, lesquels elles ont quittés et pourquoi.
Deux noms reviennent presque partout : Qonto pour la banque, Pennylane pour la comptabilité. C'est sur les notes de frais et la facturation que les choix divergent le plus, et que les changements sont les plus fréquents.
Quels outils finance utilisent ces 13 entreprises ?
- Agorapulse : Xero pour la comptabilité, Chargebee pour la facturation, Fincome pour les métriques SaaS et Spendesk pour les dépenses.
- Ankorstore : passe de Spendesk à Payhawk pour les notes de frais.
- Collective : Qonto, Pennylane, Stripe pour les abonnements et ChartMogul pour suivre l'ARR.
- Didomi : Pennylane à la place de QuickBooks, Upflow pour le recouvrement et Payhawk pour les notes de frais.
- Figures : Spendesk depuis au moins quatre ans, Pennylane via son cabinet comptable, Qonto à ses débuts.
- Folk : Qonto pour la banque, Spendesk pour les factures et les dépenses.
- MerciYanis : Qonto pour la banque et les notes de frais, à la place de Spendesk.
- Meteoria : Qonto pour la banque, Pennylane pour la comptabilité, Stripe pour la facturation.
- Partoo : Chargebee et Evoliz pour la facturation, en cours de refonte, Upflow pour le recouvrement, Spendesk pour les dépenses.
- Qobra : Pennylane pour la comptabilité, Hyperline pour la facturation.
- Shine : Chargebee pour les activités product-led, Zuora pour les activités sales-led du groupe.
- Teamtailor : Revolut pour les dépenses.
- Waalaxy : Qonto, Revolut pour les flux en dollars, Pennylane et Stripe.
Banque : Qonto presque partout
Cinq de ces entreprises ont
Qonto comme banque principale, et Figures l'a utilisé à ses débuts. Les raisons se ressemblent : l'ouverture rapide du compte, l'interface et les intégrations.
Chez Meteoria, Idriss Khouader, cofondateur et CEO, connaissait déjà Qonto grâce à ses entreprises précédentes et n'a pas cherché beaucoup plus loin. L'entreprise a envisagé le compte bancaire de
Pennylane, mais a gardé Qonto, notamment pour la rémunération de sa trésorerie, de l'ordre de 2 %. Idriss Khouader garde une réserve : pour obtenir certains prêts, une relation avec une banque traditionnelle peut devenir nécessaire.
Waalaxy a choisi Qonto pour les opérations quotidiennes et
Revolut pour les flux internationaux, notamment en dollars. Toinon Georget, cofondateur, a branché un agent IA sur l'API de Qonto : à réception d'une facture, l'agent identifie la société concernée et prépare le virement, que Toinon valide ensuite lui-même.
« Pour moi, les 3 grands avantages de Qonto sont vraiment la qualité du produit, l'UX et les intégrations qu'ils proposent. »
Toinon Georget, cofondateur de WaalaxyCollective utilise Qonto pour ses opérations courantes, pour sa simplicité et son coût, et garde un compte chez BNP Paribas pour ses financements. Chez Teamtailor, c'est Revolut qui gère les cartes et les dépenses.
« Revolut, c’est l’expérience la plus simple du monde. »
Comptabilité : Pennylane, souvent choisi par le cabinet
Pennylane est présent chez sept de ces entreprises, et les stacks recensées par Soft Atlas le placent nettement devant Qonto. On nous le dit souvent chez Soft Atlas : il arrive par l'expert-comptable plutôt que par l'équipe. Chez Qobra, il a été adopté un an et demi à deux ans après la création, sur sa recommandation. Chez Meteoria, Figures et MerciYanis, c'est le cabinet qui l'utilise au quotidien, et le CEO de Meteoria reconnaît qu'il ouvre lui-même assez peu l'application.
Didomi l'a adopté il y a environ trois ans pour remplacer QuickBooks, après l'arrêt de ce dernier en France, et se dit satisfait de la migration. Chez Waalaxy, Pennylane centralise les factures fournisseurs, les justificatifs et les mouvements des différents comptes bancaires. Toinon Georget, qui l'utilise pour environ sept sociétés, est en revanche critique sur le prix de l'API : environ 50 euros par mois et par société.

Pennylane ne convient pas à toutes les structures. Agorapulse, qui réunit une holding française et des filiales aux États-Unis et au Canada, utilise
Xero, avec un comptable français pour adapter la comptabilité aux exigences françaises.
« Avoir un logiciel de compta qui fait tout, on ne l’a pas trouvé. On bricole. »
Emeric Ernoult, fondateur et CEO d'AgorapulseQonto ou Pennylane : bientôt une seule plateforme ?
La frontière entre les deux s'estompe. Qonto renforce ses fonctionnalités comptables, notamment depuis le rachat de Regate en 2024, et Pennylane développe ses services bancaires. Théo Bartholmé, Head of Finance & Operations chez Collective, suit cette convergence de près.
« J'ai l'impression que c'est plus facile pour Pennylane d'ajouter des services bancaires que pour Qonto de construire toute la partie comptabilité. Pennylane part d'un métier assez complexe, alors que les fonctionnalités bancaires me semblent plus simples à intégrer. »
Théo Bartholmé, Head of Finance & Operations chez CollectiveAucune de ces entreprises n'a pourtant franchi le pas. Collective ne voit pas de raison suffisante de quitter Qonto, et Meteoria a écarté le compte Pennylane. MerciYanis envisage plutôt l'inverse d'une plateforme unique : une stack resserrée autour de Qonto et de Pennylane, qui lui permettrait de quitter
Axonaut, encore utilisé pour les devis et la facturation.
Notes de frais : l'outil qui change le plus
C'est la brique la plus souvent remplacée dans ces entretiens, et presque toujours pour la même raison : le rapport entre le prix et l'usage réel. Dans les stacks recensées par Soft Atlas, Spendesk reste pourtant bien plus répandu que Payhawk.
MerciYanis utilisait déjà Qonto comme banque. Quand
Spendesk a proposé de quasiment doubler le prix de l'abonnement en ajoutant des fonctionnalités, l'entreprise y a transféré ses notes de frais. Guillaume Blanc, CEO, décrit une migration simple.
« Toutes ces fonctionnalités de Spendesk ne nous intéressaient pas. On souhaitait juste le truc de base. Qonto y répondait. »
Guillaume Blanc, CEO de MerciYanis
Ankorstore vient de passer de Spendesk à
Payhawk, pour deux critères : la simplicité d'utilisation et le prix.
« Je n’ai même pas besoin d’être formé sur l’outil. Les notifications sont très bien. Je valide en deux clics. C’est clair et lisible pour moi en tant que manager. »
Gabriel de Chazournes, Directeur Commercial France chez AnkorstoreDidomi a aussi adopté Payhawk, en remplacement d'un logiciel français qui répondait difficilement aux besoins d'une organisation présente dans plusieurs pays. Après quelques mois, le premier bilan est positif.
Spendesk garde pourtant ses fidèles. Figures l'utilise depuis au moins quatre ans et s'en dit satisfait, Agorapulse rapporte de bons retours de sa directrice financière, et Folk s'en sert pour centraliser ses factures. Chez Partoo, il couvre les besoins essentiels, même si l'expérience paraît moins fluide qu'auparavant.
Facturation : Stripe, Hyperline ou Chargebee ?
Collective est passée de Mangopay à
Stripe avec son pivot vers le SaaS. Environ 90 % de sa facturation passe aujourd'hui par Stripe, et les commerciaux créent eux-mêmes des liens de paiement pour les offres personnalisées.
« Ce qui est vraiment pratique avec Stripe, c'est que tu peux quasiment tout faire depuis le dashboard. Si un client veut changer d'abonnement ou faire un upsell, tu peux le gérer directement. Tu n'as pas besoin de développer une intégration API pour chaque opération. »
Théo Bartholmé, Head of Finance & Operations chez CollectiveCollective garde Pennylane pour les grands comptes qui paient par virement, avec plus d'interventions manuelles. Qobra a fait le constat inverse : facturer dans Pennylane restait trop manuel pour des contrats aux dates de renouvellement, aux produits et aux devises multiples. L'entreprise a adopté
Hyperline il y a environ deux ans.
Partoo refond sa stack financière.
Chargebee a historiquement géré une partie des abonnements,
Evoliz une autre part importante de la facturation, et les intégrations construites avec Salesforce sont devenues difficiles à maintenir.
« Evoliz est un excellent outil jusqu'à une certaine taille d'entreprise, avec un très bon rapport qualité-prix. »
Clément Bouillaud, directeur des opérations de PartooChez Shine, deux outils devraient continuer à coexister : Chargebee pour les activités product-led de Shine,
Zuora pour les activités sales-led du groupe Cegid, dont les catalogues sont plus complexes. Agorapulse se dit globalement satisfait de Chargebee, avec une réserve sur le support.
Recouvrement et métriques SaaS
Deux briques complètent souvent la stack une fois l'entreprise plus grande : le recouvrement et le suivi des métriques SaaS.
Didomi avait abandonné
Upflow au profit des relances intégrées à Pennylane, jugées suffisantes à l'époque. Upflow est revenu présenter les évolutions de son produit, notamment l'automatisation des relances, et Didomi l'a réadopté, cette fois connecté à Pennylane.

Pour l'ARR, le MRR et le churn, Agorapulse a quitté
ChartMogul pour
Fincome, connecté à Chargebee.
« Fincome est moins cher que ChartMogul. Ca fait la même chose, voire mieux, pour un prix beaucoup plus raisonnable. »
Emeric Ernoult, fondateur et CEO d'AgorapulseCollective reste sur ChartMogul, mais doit y recréer à la main les abonnements facturés dans Pennylane. Théo Bartholmé a commencé à échanger avec Fincome, qui sait consolider plusieurs sources de facturation, sans projet de migration à court terme.
« ChartMogul, c'est très simple à utiliser en self-service. Fincome propose davantage d'accompagnement et peut mieux répondre à des besoins complexes, notamment avec Pennylane. »
Théo Bartholmé, Head of Finance & Operations chez CollectiveQuestions fréquentes
Qonto ou Pennylane pour une startup ?
Dans ces entretiens, les deux se complètent plus qu'ils ne s'opposent : Qonto pour la banque, Pennylane pour la comptabilité, souvent tenue par le cabinet. Meteoria a étudié le compte bancaire de Pennylane et gardé Qonto, notamment pour la rémunération de sa trésorerie.
Spendesk, Payhawk ou Qonto pour les notes de frais ?
MerciYanis a rapatrié ses notes de frais chez Qonto, sa banque, après une hausse de prix de Spendesk. Ankorstore et Didomi sont passés à Payhawk, pour sa simplicité et son prix ou pour son usage multi-pays. Figures, Agorapulse, Folk et Partoo restent sur Spendesk.
Faut-il un outil de facturation en plus de Pennylane ?
Dès que les contrats se compliquent, souvent oui. Qobra a adopté Hyperline pour gérer des renouvellements, des produits et des devises multiples. Collective facture 90 % de ses abonnements avec Stripe et réserve Pennylane aux grands comptes payés par virement.
À propos de ces entretiens
Soft Atlas interroge des dirigeants et des équipes finance et opérations sur les logiciels qu'ils utilisent vraiment au quotidien : ce qu'ils ont choisi, ce qu'ils ont quitté et pourquoi. Chaque entretien devient un cas d'usage publié sur Soft Atlas, relu par l'entreprise avant publication, et vient compléter la stack de l'entreprise sur Soft Atlas. Les citations de cet article en sont extraites mot pour mot ; les tendances d'ensemble viennent des stacks recensées par Soft Atlas.
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